O asedio do castelo de Amaiur acabou coa derrota dos navarros. Os soldados españois destruíron os muros do castelo en canonazos tras varios días de asediación á fortaleza. Con esta derrota, tras a conquista de 1512, acabouse o terceiro intento legitimista de recuperar o Reino de Navarra. A represión foi dura e os soldados casteláns exterminaron sistematicamente por Navarra os pobos, sexan ou non partidarios deles.