Només els lluitadors navarresos van quedar a Hondarribia amb la ciutat assetjada pels espanyols. Coronat per Carles I d'Espanya i el V d'Alemanya en la catedral de Pamplona, va permetre als legitimistes navarresos ser commutats i condonats davant si, commutant la pena de mort i mantenint el decomís dels seus béns. Molts navarresos es van negar i les tropes espanyoles es van tancar a Hondarribia, assetjada pels aliats francesos. Els francesos van acceptar la rendició, però els navarresos no. Els navarresos que van quedar van mantenir la resistència fins al 29 d'abril, amb la bandera de Navarra, i llavors van jurar la ciutat a canvi de perdó. El perdó, no obstant això, era un frau i va ser un exili amnistiforme.